Table 2 |
|||||||
|
Transmission approach: TDT results of 30 from 96 tested SNPs in 210 families of the German Asthma Family Study. Shown are only SNPs with at least one TDT results of p < 0.05. The underlined 11 SNPs also appear in table 3. |
|||||||
|
SNP |
Gene |
Genomic position HG17 |
MAF |
P asthma |
P log(IgE) |
P log(25- OH-D3) |
P log(1,25- OH2-D3) |
|
|
|||||||
|
rs3024498 |
IL10 |
1203329924 |
0,26 |
0,2654 |
0,4625 |
0,0093 |
0,4479 |
|
rs1518111 |
IL10 |
1203333040 |
0,22 |
0,7087 |
0,0487 |
0,4962 |
0,6031 |
|
rs10000076 |
IL10 |
1203334410 |
0,02 |
0,3711 |
0,2364 |
0,2374 |
0,0030 |
|
Il10-571CA |
IL10 |
1203334805 |
0,24 |
0,0247 |
0,3310 |
0,5889 |
0,3857 |
|
rs1800895 |
IL10 |
1203334867 |
0,01 |
0,0039 |
0,5237 |
0,1152 |
0,3891 |
|
rs1800894 |
IL10 |
1203335061 |
0,03 |
0,7773 |
0,5154 |
0,0101 |
0,1727 |
|
rs222040 |
GC |
4072981967 |
0,43 |
0,9211 |
0,0163 |
0,3829 |
0,0662 |
|
rs7041 |
GC |
4072983369 |
0,43 |
0,8812 |
0,0249 |
0,3884 |
0,0827 |
|
rs221999 |
GC |
4073014083 |
0,24 |
0,1475 |
0,2755 |
0,0027 |
0,1920 |
|
rs1042714 |
ADRB2 |
5148186666 |
0,40 |
0,8532 |
0,8492 |
0,0139 |
0,7524 |
|
rs1433048 |
IL12B |
5158688423 |
0,18 |
0,3452 |
0,5814 |
0,4184 |
0,0339 |
|
rs2546890 |
IL12B |
5158692478 |
0,45 |
0,0236 |
0,9066 |
0,5667 |
0,1599 |
|
rs10500804 |
CYP2R1 |
11014866849 |
0,45 |
0,2242 |
0,0418 |
0,0833 |
0,8352 |
|
rs1562902 |
CYP2R1 |
11014874792 |
0,43 |
0,1342 |
0,0443 |
0,1063 |
0,8049 |
|
rs10766197 |
CYP2R1 |
11014878456 |
0,48 |
0,4700 |
0,0284 |
0,0459 |
0,7258 |
|
rs7975232 |
VDR |
12046525104 |
0,49 |
0,2484 |
0,0400 |
0,9235 |
0,9351 |
|
rs2239186 |
VDR |
12046555677 |
0,19 |
0,0350 |
0,7521 |
0,9212 |
0,5459 |
|
rs1805011 |
IL4R |
16027281373 |
0,11 |
0,2334 |
0,0090 |
0,1110 |
0,2684 |
|
C406R |
IL4R |
16027281467 |
0,15 |
1,0000 |
0,0255 |
0,6542 |
0,1249 |
|
rs1805015 |
IL4R |
16027281681 |
0,16 |
0,8744 |
0,0003 |
0,4956 |
0,1197 |
|
Q551R |
IL4R |
16027281901 |
0,25 |
0,2482 |
0,0017 |
0,9661 |
0,8287 |
|
rs1805016 |
IL4R |
16027282428 |
0,05 |
0,2076 |
0,0082 |
0,0002 |
0,7390 |
|
rs10000306 |
CARD15 |
16049288266 |
0,04 |
0,6473 |
0,0417 |
0,4739 |
0,5429 |
|
rs3135499 |
CARD15 |
16049323628 |
0,37 |
0,0374 |
0,2742 |
0,3929 |
0,8405 |
|
rs2045387 |
IL12RB1 |
19018061586 |
0,24 |
0,6826 |
0,7907 |
0,0145 |
0,3191 |
|
rs2296241 |
CYP24A1 |
20052219626 |
0,50 |
0,0046 |
0,9291 |
0,8917 |
0,5098 |
|
rs17219315 |
CYP24A1 |
20052221853 |
0,02 |
0,8658 |
0,6289 |
0,0095 |
0,3056 |
|
rs2762942 |
CYP24A1 |
20052222332 |
0,04 |
0,7140 |
0,1506 |
0,2030 |
0,0397 |
|
rs2248137 |
CYP24A1 |
20052223150 |
0,39 |
0,0256 |
0,8250 |
0,2567 |
0,9096 |
|
rs2248359 |
CYP24A1 |
20052224925 |
0,36 |
0,0158 |
0,9302 |
0,2284 |
0,8510 |
|
|
|||||||
|
Wjst et al. Respiratory Research 2006 7:60 doi:10.1186/1465-9921-7-60 |
|||||||